Брат осужденного, Андрей, поделился с журналистами подробностями дела своего родственника. В январе 2019 года Московский окружной военный суд, проводя выездное заседание в Санкт-Петербурге, вынес приговор, согласно которому Шишкин был осужден на 3,5 года колонии общего режима.
Молодой человек был признан виновным в участии в террористическом сообществе под названием «Сеть». Эта организация, о которой известно исключительно из обвинительных материалов, была признана террористической и подлежит запрету в России.
Особенностью процесса по делу Шишкина стало его рассмотрение в особом порядке, при котором он полностью признал свою вину. Однако, как сообщают другие фигуранты дела, в ходе следствия имели место случаи применения пыток.