В настоящее время он сосредоточен на подготовке к защите своей диссертации. Бывший полковник ГРУ оценил решение присяжных, оправдавших его, как акт гражданского мужества. Он подчеркнул, что «суд присяжных — это единственный суд, который остался правосудным в России».
По словам Квачкова, защите было сложно участвовать в процессе, так как свидетели не допускались на заседания, а подсудимых время от времени удаляли из зала суда. В то же время Анатолий Чубайс охарактеризовал решение присяжных как «ошибку». Адвокат Квачкова, Андрей Шугаев, выразил предположение о том, что прокуратура может обжаловать вынесенный приговор.
Стоит отметить, что помимо Анатолия Квачкова, по этому делу проходили два бывших десантника — Александр Найденов и Роберт Яшин. Все трое обвинялись по пяти статьям, в том числе в покушении на жизнь государственного деятеля и убийстве, совершенном общественно опасным путем. Судебный процесс проходил в закрытом режиме, и в ходе разбирательства были распущены две коллегии присяжных.