В ходе расследования газета «Коммерсант» выяснила, что дело о признании Фонда борьбы с коррупцией (ФБК) экстремистской организацией было засекречено из-за наличия личных данных сотрудников силовых структур. Гриф «секретно» был присвоен в связи с подачей исков о причинении ущерба к участникам протестных митингов, как сообщил источник в правоохранительных органах.
Издание также ознакомилось с незасекреченными материалами по делу, в которых находятся некоторые доказательства, представленные прокуратурой. В частности, в этих материалах собраны списки людей, привлеченных к ответственности, например, по статьям об экстремизме или нарушении законодательства о митингах. Среди них есть не только соратники Алексея Навального, но и лица, чья связь с оппозиционерами не указана даже косвенно. К примеру, в документах упоминается житель Татарстана, который разместил фотографию Гитлера на сайте «Бессмертного полка».
Некоторые из подготовленных списков пришли от областных прокуратур, где отмечается, что на действия привлеченных за экстремизм людей оказывали влияние штабы Навального. Среди обнародованных документов имеется и отчет Центризбиркома, в котором говорится о том, что Навальный выступал против поправок к Конституции, а перед выборами в Государственную Думу призывал применять систему «Умное голосование» и участвовать в протестных акциях.
Прокуратура утверждает, что целью штабов и фондов было «создание условий» для изменения основ конституционного строя с применением «сценария цветной революции». Важно отметить, что ФБК уже был признан российскими властями иностранным агентом.