После смены руководства учреждения уникальные коллекции, собранные научными сотрудниками, оказались под угрозой расформирования. Бывший директор института Татьяна Клявина сообщила о значительных потерях, которые могут понести архивы. Она отметила: “Выкинут из института колоссальный архив, посвященный Аркадию Исааковичу Райкину, который собирал Виктор Александрович Голомбевский. В институте было несколько выставок. Это было очень большое собрание. Было велено это немедленно вывезти. Прежнее руководство министерства обсуждало вопрос о введении этой коллекции в архивный фонд, её узаконивание, чтобы она стала уникальным собранием. Сейчас это просто выкинуто из института.”
Под угрозой уничтожения также оказался архив рукописных документов и коллекция кинокабинета, где собраны данные обо всех вышедших фильмах за последние полвека. Неизвестна судьба институтской библиотеки, занимающей треть здания, где хранится полмиллиона экземпляров. Предполагается, что её фонд могут расформировать и распределить по другим библиотекам.
