Суд признал, что взыскание многомиллиардного ущерба по первому уголовному делу Ходорковского является нарушением его прав. Также отмечено, что помещение подсудимых в металлическую клетку в зале суда унижает достоинство. В результате, Европейский суд обязал Россию выплатить Ходорковскому компенсацию в размере 10 тысяч евро, а в выплате Платону Лебедеву было отказано.
Российская правовая система теперь должна вернуться к первому делу ЮКОСа из-за выявленных Европейским судом по правам человека нарушений. В то же время, пересмотр всего дела не будет необходим, как сообщил Михаил Федотов, глава президентского совета по правам человека. Он выразил удовлетворение решением, которое наконец было принято по этому делу.
Федотов также отметил, что в Страсбурге имеются и другие жалобы Ходорковского и Лебедева, которые ожидают своего рассмотрения.